Në temperaturë ambienti, skualeni është një lëng vajor i kthjellët, pa ngjyrë deri në të verdhë të zbehtë, me një erë të dallueshme të vajit të mëlçisë së peshkut; është shumë i ndjeshëm ndaj oksidimit. Strukturisht, ai përbëhet nga gjashtë njësi izopreni dhe përmban gjashtë lidhje të dyfishta, duke e bërë atë shumë të paqëndrueshëm. Është i patretshëm në ujë, por tretet lehtësisht në tretës organikë si dietil eteri, acetoni dhe tetrakloruri i karbonit.